Semizotu, sıklıkla tüketilen hoş bir sebze olsa da, bazı yan etkileri bulunmaktadır. Özellikle böbrek rahatsızlığına sahip olanların, tedbirli olması gerekir; semizotu tüketimi böbrekleri yükleyebilir. Ayrıca, aşırı tüketildiğinde midye sorunlarına meydana olabilir. Gebeliğini taşıyan kadınlar da se